Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFVQ71UI9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFVQ71UI9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 603.4 ms