Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 517.21■□□□□ 0.351e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.017e-10■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.137e-10■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-210ENST00000479587 701 ntTSL 213.59□□□□□ -0.231e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.427e-10■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-209ENST00000460760 1025 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 59.73□□□□□ -0.851e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-204ENST00000415904 649 ntTSL 39.28□□□□□ -0.921e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-206ENST00000435123 389 ntTSL 58.24□□□□□ -1.091e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 55.33□□□□□ -1.561e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-12■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-12■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 SAP18-203ENST00000467636 670 ntTSL 59.4□□□□□ -0.92e-12■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-12■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 314.78□□□□□ -0.048e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.678e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.98e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.998e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.268e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.488e-24■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 MRPL51-204ENST00000540949 343 ntTSL 215.55■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 38.26□□□□□ -1.095e-10■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 519.7■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 316.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 411.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 210.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 310.1□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 39.68□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 39.44□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 39.19□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 39.11□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 38.9□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 47.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 45.93□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 45.53□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 45.53□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 43.86□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-210ENST00000488338 533 ntTSL 313.83□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 312.9□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-211ENST00000490633 401 ntTSL 312.58□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.546e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 CTSD-204ENST00000433655 2006 ntTSL 516.96■□□□□ 0.316e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.226e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.086e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.076e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 515.5■□□□□ 0.076e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 214.62□□□□□ -0.076e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 313.88□□□□□ -0.196e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.616e-21■■■■■ 27
LARP4Q71RC2 MT1X-204ENST00000568370 1727 nt15.28■□□□□ 0.042e-15■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-15■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-15■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 MT1X-203ENST00000564974 549 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.142e-15■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 IGF2R-202ENST00000464636 570 ntTSL 56.63□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-211ENST00000430901 483 ntTSL 415.34■□□□□ 0.051e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-212ENST00000445816 2099 ntTSL 315.09■□□□□ 0.011e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.341e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.41e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-216ENST00000486144 1030 ntTSL 211.21□□□□□ -0.611e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.861e-31■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-10■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.314e-10■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 TEX261-205ENST00000478068 3579 ntTSL 29.63□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 AC007040.2-202ENST00000453130 423 ntTSL 37.35□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 HLA-A-205ENST00000461903 1352 nt21.1■□□□□ 0.972e-32■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.522e-32■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 HLA-A-206ENST00000479320 1334 nt16.22■□□□□ 0.192e-32■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 MINOS1-207ENST00000486890 677 ntTSL 310.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 26.9
LARP4Q71RC2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.338e-12■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 TOMM7-204ENST00000463284 731 ntTSL 211.9□□□□□ -0.58e-12■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.228e-12■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.036e-24■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.066e-24■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.556e-24■■■■■ 26.8
LARP4Q71RC2 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 322.09■■□□□ 1.134e-9■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 417.4 ms