Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BEND4Q6ZU67 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEND4Q6ZU67 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEND4Q6ZU67 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms