Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms