Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC73Q6ZRK6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms