Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM72Q6ZMU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM72Q6ZMU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms