Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYHR1Q6ZMK1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYHR1Q6ZMK1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms