Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARA5Q6ZMJ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARA5Q6ZMJ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms