Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBSNQ6UWP8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SBSNQ6UWP8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms