Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC25A47Q6Q0C1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A47Q6Q0C1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms