Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNV1Q6PIU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNV1Q6PIU1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNV1Q6PIU1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms