Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM88Q6PEY1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM88Q6PEY1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms