Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CTR9Q6PD62 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTR9Q6PD62 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTR9Q6PD62 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms