Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC4Q6P4E1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms