Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1AQ6P1N0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms