Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGB2Q6NT52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms