Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN13Q6MZZ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN13Q6MZZ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms