Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A4Q6AI14 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms