Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTY2D1Q68D10 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTY2D1Q68D10 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTY2D1Q68D10 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms