Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TNS3Q68CZ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNS3Q68CZ2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms