Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CREB3L3Q68CJ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CREB3L3Q68CJ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3L3Q68CJ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms