Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9BQ674R7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms