Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LARP1BQ659C4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1BQ659C4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms