Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GGNBP1Q5YKI7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GGNBP1Q5YKI7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GGNBP1Q5YKI7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms