Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHEQ5VZ18 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms