Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOCADQ5VW36 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms