Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF38BQ5VTL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF38BQ5VTL8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF38BQ5VTL8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF38BQ5VTL8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms