Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF220Q5VTB9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms