Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PXDC1Q5TGL8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PXDC1Q5TGL8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PXDC1Q5TGL8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PXDC1Q5TGL8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PXDC1Q5TGL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PXDC1Q5TGL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PXDC1Q5TGL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms