Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BEND3Q5T5X7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BEND3Q5T5X7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BEND3Q5T5X7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms