Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC183Q5T5S1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms