Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDLRAP1Q5SW96 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAP1Q5SW96 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms