Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2D4BQ5SQS7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D4BQ5SQS7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms