Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms