Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB41Q5JT25 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB41Q5JT25 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms