Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms