Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD12Q587J7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms