Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms