Protein–RNA interactions for Protein: Q49A92

C8orf34, Uncharacterized protein C8orf34, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf34Q49A92 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
C8orf34Q49A92 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C8orf34Q49A92 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C8orf34Q49A92 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms