Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB8Q3ZCM7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB8Q3ZCM7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms