Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00303Q3SY05 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms