Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
KRTAP20-1Q3LI63 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms