Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP25-1Q3LHN0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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