Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TWISTNBQ3B726 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TWISTNBQ3B726 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms