Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C18orf21Q32NC0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms