Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ISXQ2M1V0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ISXQ2M1V0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms