Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
QSER1Q2KHR3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
QSER1Q2KHR3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
QSER1Q2KHR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
QSER1Q2KHR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
QSER1Q2KHR3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
QSER1Q2KHR3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
QSER1Q2KHR3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms