Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIK5Q16478 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK5Q16478 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK5Q16478 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK5Q16478 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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