Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA4Q16363 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA4Q16363 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA4Q16363 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA4Q16363 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMA4Q16363 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMA4Q16363 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA4Q16363 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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