Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC6Q16204 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC6Q16204 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
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